Medical Systems Biology
2. Förderphase (01.22 - 06.25)
Infrastrukturlinie
NUM-DIZ
Grundlage für dieses Projekt sind die in der Medizininformatik-Initiative (MII) aufgebauten Strukturen und Datenintegrations-zentren (DIZ) an den Standorten. Lokal soll sich das DIZ zu einem umfassenden Forschungsinfrastrukturdienstleister entwickeln, der eine Vielzahl medizinischer Forschungsszenarien für die Forschung am Standort, insbesondere aber für die vernetzte Forschung über Standorte hinweg unterstützt. Jeder NUM-DIZ-Partner baut dazu eine effiziente technische, personelle und organisatorische Infrastruktur auf. Dadurch stehen flächendeckend an allen deutschen Universitätsklinika Infrastrukturen bereit, die eine vernetzte Forschung mit Gesundheitsdaten ermöglichen.
Projektleiter am Standort Ulm: Prof. Hans A. Kestler (Insitut für Medizinische Systembiologie)
NUM-RDP
Das Projekt ist eng verzahnt mit dem Projekt NUM-DIZ: in NUM-RDP werden zentrale Schlüsselkomponenten errichtet, an denen sich die Datenintegrationszentren (DIZe) der Standorte anschließen. In Zukunft wird dies durch weitere Bausteine angereichert, die innerhalb der MII-Förderlinie bereitgestellt werden (z.B. das Deutsche Forschungsportal für Gesundheit, FDPG).
Projektleiter am Standort: Prof. Dr. Hans A. Kestler (Institut für Medizinische Systembiologie)
RACOON
RACOON stellt erfolgreich die Forschungsinfrastruktur für die medizinische bildbasierte Forschung bereit. Es ist als nationale Forschungsplattform konzipiert, die ein komplettes Ökosystem für modernen bildbasierte medizinische Forschungsprojekte zur Verfügung stellt und unterhält. RACOON legt besonderen Wert auf Benutzerfreundlichkeit und schafft eine einzigartige kollaborative Umgebung, indem es alle radiologischen Abteilungen innerhalb des Deutschen Netzwerks der Universitätsmedizin als Partnerstandorte unter Einhaltung des Datenschutzes einbezieht.
Projektleiter am Standort: Prof. Dr. Meinrad Beer (Klinik für Diagnostische und Interventionelle Radiologie)
Forschungslinie
CODEX+
Das Projekt CODEX+ hat die NUM-Routinedatenplattform (ehemals CODEX-Plattform) aus der ersten Förderphase um technische und organisatorische Aspekte erweitert. Damit können nun die erfolgreichen Lösungen aus verschiedenen NUM-Projekten in einer gemeinsamen Infrastruktur der Universitätskliniken betrieben und genutzt werden. Um auch zukünftig im Sinne der "Pandemic Preparedness" schnell auf neue Anforderungen reagieren zu können, etwickelte CODEX+ generische Komponenten und Konzepte. Hierzu kam eine Beratungsinfrastruktur für Netzwerkpartner, die Anwendungen auf Basis von Daten aus der Krankenversorgung entwickeln und im Netzwerk implementieren wollen.
coverChild: COVID-19 Forschungsplattform für Kinder und Jugendliche
Ziel des Projekts ist es, die besonderen Krankheitsausprägungen, Vulnerabilitäten und Folgen der Pandemie bei Kindern und Jugendlichen durch eine interdisziplinäre Forschungsplattform zu untersuchen und damit die Grundlage für adäquate und zeitgerechte Reaktionen uaf zukünftige Herausforderunge zu schaffen.
Mehr Informationen auf der NUM-Projekt-Homepage.
Projektleitung am Standort Ulm: Prof. Dr. Jörg Fegert (Klinik für Kinder- und Jugendpsychiatrie/Psychotherapie)
COVIM 2.0: Collavorative Immunity Platform of the NUM
In der zweiten Förderphase wird COVIM skalierbare Infrastrukturen für die schnelle Erfassung und Analyse von komplexen Datensätzen zur Immunität gegen COVID-19 und gegen künftige pandemische Bedrohungen etablieren und bestehende Strukturen und Netzwerke weiter ausbauen. Ein Hauptfokus liegt dabei auf der Standardisierung und Skalierbarkeit von Messplattformen und der Interoperabilität und Verfügbarmachung von Immundaten. Dadurch sollen Informationen über die Immunitätslage gegen pathogene Bedrohungen möglichst in Echtzeit zur Verfügugn gestellt werden. Dies erlaubt schnelle Reaktionen und wissenschaftlich gestützte Entscheidungen im Hinblick auf mögliche Interventionen während eines Ausbruchsgeschehens.
Projektleiter am Standort Ulm: Prof. Dr. Frank Kirchhoff (Institut für Molekulare Virologie)
PREPARED
Das Ziel von PREPARED ist die Entwicklung eines Konzepts für eine umfassend realisierbare, kooperative, adaptierbare und nachhaltige Infrastruktur für das Pandemie-Management und die Pandemie-Vorbereitung im Rahmen des NUM. Diese wird eine koordinierte, zügige, gezielte und evidenzbasierte Aktion und Reaktion auf Bedrohungen für dei patientenversorgung und die Gesundheit der Bevölkerung aufgrund einer pandemischen Lage mit ermöglichen.
Projektleiter am Standort: Prof. Dr. Michael Denkinger (Insitut für Geriatrische Forschung)
RACOON COMBINE: Entwicklung und Anwendung von bildbasierten Biomarkern zur Vorhersage und Prognosebewertung von Patienten mit COVID-19
Ziel des Projekts war die Entwicklung und Umsetzung einer Pipeline für die Extratkion COVID-spezifischer, prädiktiver und prognostischer quantitativer Bildgebungs-Biomarker, um eine umfassende Phänotypisierung zu ermöglichen.
Projektleitung am Standort Ulm: Prof. Dr. Meinrad Beer (Klinik für Diagnostische und Interventionelle Radiologie)
RACOON-PDAC: Development of Predictive Biomarkers for Systemic Therapy of Pancreatic Cancer
Das primäre Ziel des Projektes ist die Verbesserung der Prognose von Patientinnen und Patienten mit Pankreas-Adenokarzinom (PDAC) durch die Identifizeirung von prädiktiven Biomarkern, welche eine individualisierte und damit langfristig effektivere Erstlinien-Chemotherapie für PDAC-Patientinnen und -Patienten ermöglichen.
Projektleitungen am Standort Ulm: Prof. Meinrad Beer (Klinik für Diagnostische und Interventionelle Radiologie) & Prof. Dr. Thomas T.W. Seufferlein (Klinik für Innere Medizin I)
RAOON-RESCUE: Radiological Evaluation and Stratification of Childhood Lymphoma by Use of Expert AI
Das Forschungsvorhaben hat die Ziele, die bildgebende Stadieneinteilung mittels radiologischer Diagnostik pädiatrischer Non-Hodgkin-Lymphome (NHL) zu verbessern, invasive Eingriffe zur Klärung von Reststrukturen zu vermeiden und neue bildbasierte Biomarker zu entwickeln.
Projektleitung am Standort Ulm: Prof. Dr. Meinrad Beer (Klinik für Diagnostische und Interventionelle Radiologie)
Job Openings
Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d)
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